Especies Endémicas:
- colibrí berilo (Amazilia berillyna), rascador cejas verdes (Arremon virenticeps), rascador gorra canela (Atlapetes pileatus), Zumbador Mexicano (Atthis heloisa), rascador cejas verdes (Arremon vrenticeps), matraca barrada (Campylorhynchus megalopterus), chipe rojo (Cardellina rubra), (), murciélago mula mexicano (Corynorhinus mexicanus), codorniz coluda transvolcánica (Dendrortyx macroura), lili (Echeandia mexicana), mapache de las islas Marías (Procyon lotor subsp. insularis), rana de árbol de montaña (Hyla eximia), rana de árbol plegada o surcada (Hyla plicata), calandria flancos negros (Icterus abeillei), cuatolotlanenzi (Iostephane heterophylla), Trepatroncos Mexicano (Lepidocolaptes leucogaster), rana leopardo de Moctezuma (Lithobates montezumae), mulato azul (Melanotis caerulescens), Zacatón, Soromuta (Muhlenbergia macroura), pañuelo (Norops nebulosus), Zacatonero Serrano (Oriturus superciliosus), camaleón, camaleón de montaña, lagartija cornuda de montaña, tapayaxín (Phrynosoma orbiculare), carpintero transvolcánico (Picoides stricklandi), rana de Moctezuma (Rana montezumae), rana manchada (Rana spectabilis), culebra acotera, culebra café coronada, culebra de collar, hojarasquera corona (Rhadinaea laureata), mirlo azteca (Ridgwayia pinicola), hediondilla (Roldana lineolata), lagartija espinosa menor (Sceloporus jarrovi minor), lagartija espinosa de pastizal (Sceloporus scalaris), culebra de agua (Thamnophis scaliger), salta pared feliz (Thryothorus felix), cuicacoche moteado (Toxostoma ocellatum), mirlo dorso canela (Turdus rufopalliatus), Vireo Pizarra (Vireo brevipennis), Vireo Enano (Vireo nelsoni), Vireón alerquín (VireolanIus melitophrys), gorrión serrano (Xenospiza baileyi), conejo de los volcanes (Romerolagus diazi), ratón pantanero (Peromyscus perfulvus), lagartija de árbol del pacífico (Urosaurus bicarinatus), memelilla (Verbesina oncophora)
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